北伐军在克复赣闽后，东进江浙势所必然。浙江省省长夏超一向主张“浙人治浙”，不满外省人统治，对孙传芳委派的浙江总司令卢香亭尤为反感。1926年春，孙传芳试图行调虎离山之计，拟将夏超调往江苏。此事加深了夏孙之间的矛盾。国共两党乘机派人对夏超加以策反，允诺委夏超为国民革命军第18军军长兼理浙江民政事宜。夏超于是秘密联络地方派军人进行倒孙活动，酝酿独立。浙江地方武力分为三部分，一是夏超的保安队，一是陈仪的第1师，一是周凤歧的第3师。周凤歧与夏超关系比较密切，亦有倒戈之想，但事为孙传芳所警觉，周部被孙传芳调赴江西。10月16日，夏超在杭州通电反孙，宣布浙江独立，并就任国民革命军第18军军长。孙传芳获悉夏超独立后，立即命驻防南京的孟昭月部所属第15旅旅长宋梅村为前敌总指挥，率部前往镇压。由于夏超的武力均为警察，缺乏实战经验。夏超的独立很快失败。夏本人被孙传芳处决。
孙传芳平息夏超独立事件后，任命陈仪为浙江省长，并派其嫡系孟昭月为浙江总司令。赣闽战场相继失利后，孙传芳之前线将领纷起异心。自1926年11月起，陈调元、王普、陈仪等均不满于孙的控制，而与革命军暗通款曲。11月7日孙传芳从江西撤退至南京，并将其在浙部队全部撤至沪杭、沪宁两线，集中整顿，以图再起，并决定联合奉、鲁军阀共同“反赤”。