康熙帝认为吴三桂的势力最大，野心也最大，便果断采取措施，对平南、靖南二藩软硬兼施。一方面派兵去攻打，另一方面下降书。耿精忠本来造反的决心就不大，一看朝廷出动大队人马前来平息，心里很惊慌。两军刚一交战，耿精忠就吃了败仗，他节节败退，一看大势已去，便投降了。康熙帝决定恢复他的爵位，仍镇守福建。广东的尚之信一看清军压城，也投降朝廷。
三路叛军，只剩下吴三桂，他已被孤立起来。康熙帝命令胡拜、赵赖带领清军围剿吴三桂。清军作战勇猛，吴三桂节节败退，吴三桂在内外交困中病死。三藩叛乱平定后，康熙加强了对三藩的控制，增强了皇帝的权威，巩固了国家的统一。
【精彩直击】 削藩是康熙帝在位时经历的一件大事。康熙决策英明果断，大刀阔斧，具有一个大政治家的魄力和气度。加强对三藩的控制，对增强中央权力的统一和集中，巩固国家的政权，具有相当重要的作用。